Ám Hà Truyện xoay quanh tổ chức Ám Hà, một đội sát thủ hàng đầu trong giang hồ, do ba gia tộc Tô, Mộ, Tạ thành lập. Họ vừa thực hiện các nhiệm vụ ám sát trong triều đình, vừa đàn áp các phe phái lớn.
Trong một nhiệm vụ ám sát nhị lão gia Đường Môn, đại gia trưởng của Ám Hà trúng độc, gây ra cuộc tranh chấp về quyền lực và tài sản giữa ba gia tộc. Thủ lĩnh Chu Ảnh Đoàn, Tô Mộ Vũ, cùng đồng đội của mình, trong đó có Mộ Vũ Mặc, phải bảo vệ đại gia trưởng. Trên con đường này, họ gặp nhiều trở ngại từ các thành viên trong tổ chức, bao gồm tiền bối Tô Triết và bạn bè như Tô Xương Hà, đồng thời cũng quen biết thần y Bạch Hạc Hoài.
Sau một loạt các cuộc đọ sức và thử thách, Tô Xương Hà trở thành đại gia trưởng mới của Ám Hà, còn Tô Mộ Vũ trở thành gia chủ Tô gia. Họ quyết định thực hiện “Kế hoạch Bỉ Ngạn”, một kế hoạch táo bạo nhằm biến Ám Hà thành một tổ chức mang tính chính trực, không còn là công cụ cho bất kỳ ai. Qua đó, họ tìm kiếm một lối thoát mới cho tổ chức, thoát khỏi sự phụ thuộc vào giang hồ và hoàng thất.