Luyện Khí Mười Vạn Năm xoay quanh câu chuyện về Thiên Lam Tông, một thế lực tu chân từng vang dội trong quá khứ. Mười vạn năm trước, đây là nơi đào tạo ra những đệ tử được xem là con của trời, gần như không có thất bại trong mọi trận chiến. Tuy nhiên, có một cái tên nổi bật trong số đó, Từ Dương – một trong những khai sơn đệ tử của Thiên Lam Tông.
Khác với những người đồng môn, Từ Dương vẫn ở trong giai đoạn Luyện Khí kỳ. Nhận thức được sự tụt hậu trong tu vi, Từ Dương quyết định bế quan để có thể đột phá và sớm ngày đạt được cảnh giới cao hơn, phi thăng lên cõi tiên. Thời gian bế quan của Từ Dương kéo dài vạn năm. Trong khoảng thời gian này, thế giới bên ngoài đã trải qua nhiều biến động.
Giới tu chân đã xuống dốc và Thiên Lam Tông, nơi từng là biểu tượng của sức mạnh, nay chỉ còn vài ba đệ tử. Tông môn đứng trước nguy cơ bị diệt vong. Nhận thức được tình hình, Từ Dương buộc phải xuất quan. Ông ta đánh bại những kẻ thù mạnh để đạt được một mục tiêu duy nhất: dẫn dắt Thiên Lam Tông trở lại thời kỳ đỉnh cao.
Với quyết tâm và sức mạnh tích tụ trong vạn năm bế quan, Từ Dương bắt đầu hành trình của mình, hứa hẹn sẽ mang lại vinh quang cho Thiên Lam Tông.