Siêu Nhân Omega xoay quanh câu chuyện về một người ngoài hành tinh bị mất trí nhớ rơi xuống từ bầu trời trong một thời điểm mà Trái Đất chưa từng chứng kiến sự xuất hiện của siêu anh hùng hay quái thú. Người ngoài hành tinh này lấy tên là Sorato và bắt đầu hành trình khám phá thế giới loài người, nơi mà cảm xúc và mâu thuẫn coexist.

Khi những con quái thú khổng lồ bắt đầu xuất hiện, Sorato vô thức nhớ lại sứ mệnh của mình. Từ đó, anh biến thân thành Ultraman Omega, một siêu anh hùng với khả năng đặc biệt. Vũ khí của Ultraman Omega là Omega Slugger, một công cụ mạnh mẽ giúp anh chiến đấu và bảo vệ Trái Đất khỏi những mối đe dọa.

Với sự xuất hiện của Ultraman Omega, Trái Đất chứng kiến một kỷ nguyên mới trong cuộc chiến chống lại quái thú. Sorato, với hình dạng mới, phải đối mặt với trách nhiệm bảo vệ hành tinh và khám phá thêm về bản thân mình.